代收水费银行出于经济利益的考虑，以各种理由拒绝用户以现金方式缴纳水费，造成用户缴费困难，这类问题在全国不少城市都曾存在过。现金缴费困难，造成了水费回收率下降，也影响供水服务的满意率。
南京水司多措并举，广泛利用社会资源，解决现金缴费困难，为供水企业提供了一条可供借鉴的道路。
一是与银行进一步协调。经过协调，工商银行、农业银行、邮政储蓄、民生银行、南京银行、交通银行、建设银行、光大银行、中信银行、招商银行（一卡通）、华夏银行（华夏卡）、兴业银行、浦发银行、中国银行的任意一个网点都可以办理水费代扣业务。其中邮政储蓄、民生银行、工商银行各网点还可以办理现金缴费业务。
二是提供水费代扣短信告知业务。为鼓励用户尽可能通过银行代扣水费，南京水司向银行代扣水费用户免费提供短信告知业务，用户一旦代扣成功将收到已缴费告知短信，即表明当月扣缴成功。
三是与电、气共享缴费营业厅。现金缴费难在供电、供气等行业同样存在。经过协商，水、电、气三家单位签订了共享营业厅协议，用户在三家单位的任意一营业厅都可以全部完成三项公用事业缴费。不仅提高了回收率，而且大大方便了用户。
四是开通银联缴费一站通业务。针对银联卡的广泛使用，南京水司积极与江苏省银联合作，开通银联缴费一站通业务，直接刷卡缴费，减轻特定时段排队压力。目前南京水司的五个收费营业点以及南京市部分小区安装了刷卡缴费终端，方便了市民的日常生活。
五是开通苏果超市代收水费业务。苏果超市是南京市最大的超市，门店星罗棋布，市民出门步行10分钟即可到达最近的苏果超市。苏果超市不仅网点多，而且具有营业时间长、不受双休日限制等优势。经过协商，南京水司于2007年9月20日起，在金陵小区标准店等6家苏果门店试运行水费代收业务。经过大力推广，截至6月10日，已经有百家苏果超市门店开通了代收水费业务，用户在家门口即可完成缴费，非常快捷。下一步，南京水司还将继续加大和苏果超市方面合作，力争有更多门店开通此项业务，进一步方便用户。